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Illumina为中国人群推出“中华”芯片

来源:生物通 作者:秩名 责任编辑:admin 发表时间:2018-11-20 12:08 
核心提示:Illumina公司近日推出了一款HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片,特别覆盖中国人特有的常见和稀有变异。 这款中华芯片特别地覆盖了在中国人群体中发现的常见和稀有变异,适合全基因组关联研究(GWAS)。经过优化的标签SNP内容来自HapMap所有三个阶段以及千人

Illumina公司近日推出了一款HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片,特别覆盖中国人特有的常见和稀有变异。

这款“中华”芯片特别地覆盖了在中国人群体中发现的常见和稀有变异,适合全基因组关联研究(GWAS)。经过优化的标签SNP内容来自HapMap所有三个阶段以及千人基因组计划(1kGP),经过策略性选择而创建出聚焦特定人群体的芯片,可用于在中国人种群中探索全新的疾病和性状关联。

由久经考验的Infinium® HD分析技术所支持,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片将行业领先的数据质量与高样品通量和全面的基因组内容相结合,而价格也极具吸引力。

全面的覆盖

利用来自千人基因组计划的最新内容,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片覆盖了中国人群体约81%的常见变异(r2 > 0.8),其次要等位基因频率(MAF)> 5%。它的覆盖度比竞争对手产品CHB特异的芯片(蓝色)高了10%,如下图所示。对于稀有变异(MAF > 2.5%),HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片覆盖了约60%(r2 > 0.8),比竞争产品高出7%。比较得知,HumanOmniExpress-12芯片分别覆盖了常见变异(MAF> 5%)和稀有变异(MAF > 2.5%)的75%和54%,这清晰表明HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片是中国人群GWAS研究的最佳起点。

久经考验的Infinium质量

Omni芯片家族是由全基因组Infinium® HD分析支持的。全世界的遗传学研究人员都乐意采用Infinium HD分析,加速了疾病研究的新发现,并积累了庞大的文献记录。HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片可实现对每个样品进行超过90万个标记物的图谱分析。分析采用Illumina专利的BeadArray™技术,可提供非常高的数据质量,平均检出率 > 99%,重复率 > 99.9%。高信噪比以及整体的低噪音水平可实现精确、可靠的检出和拷贝数分析。

作为Omni家族的最新成员,HumanOmniZhongHua-8 BeadChip芯片是Illumina第一款人类种群特异的全基因组芯片。它包含了智能选择的标签SNP,能全面覆盖在中国人中发现的常见和稀有变异。在久经考验的Infinium HD分析上获得最新的千人基因组计划内容,以便加速您的中国人群GWAS研究。

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